因為工業雙氧水具有強氧化性，因此選用塑料或不銹鋼的容器，而且容器蓋上要留有排氣孔，這樣可讓氣體排出.存放環境很重要，工業雙氧水要在陰涼、通風的場所中存放，避免陽光直射或受熱.存放的時候避免有堿、金屬化合物像二氧化錳、易燃品、還原劑等物質的進入。
日常消毒的是醫用雙氧水,醫用雙氧水可消滅腸道致病菌,化膿性球菌,一般用于物體表面消毒.雙氧水具有氧化作用,但醫用雙氧水濃度較低,擦拭到創傷面,表面被氧化成白色,用清水清洗一下就可以了,使用雙氧水消毒的時候會有白色的小氣泡產生是因為雙氧水遇見手指上灰塵,臟物也會分解,分解生成水,氧氣當雙氧水與皮膚,口腔和黏膜的傷口,膿液或污物相遇時,立即分解生成氧.這種尚未結合成氧分子的氧原子,具有很強的氧化能力,與細菌接觸時,能破壞細菌菌體.破壞細菌菌體后剩余的物質是無任何毒害和刺激的水,不會形成二次污染,因此濃度較低的雙氧水是傷口消毒理想的消毒劑.
